清研智库:11天12篇国际论文,我们对新冠病毒传播知道了什么?

作者: 曹兰天 清研智库研究员  刘沂铭 清研智库研究员

面对突如其来的新型冠状病毒肺炎疫情,全球科研团队通过调研、实验、数据分析等方法,对疫情进行了研究,并在预印本、期刊等平台上发布了一系列相关研究论文,我们总结和梳理了有关新冠病毒的国际学术研究。

截止到2月4日,根据条件“主题 = Novel Coronavirus or 2019-nCoV”在Web of Science数据库进行搜索,获得文献48篇,经人工判断与新冠病毒相关30篇。同时,根据条件“term = 2019-nCov”在预发布平台BioRxiv上进行搜索,获得相关论文33篇。

针对新冠病毒肺炎的研究主要集中在病毒传播与预测模型、病毒特征分析与药物研究、新闻信息综述等方面,期刊论文与预发布平台论文相比,前者更倾向于新闻信息综述,后者则更多的是病毒传播与模型预测、药品研发等等。期刊论文中,研究主题分布为病毒特征6篇、药物研制3篇、信息搜集13篇、模型预测1篇、传播7篇,其中,中国发表了12篇、国外18篇;预发布平台论文中,研究主题分布为病毒传播与预测模型研究12篇、病毒特征分析与药物研究21篇,,其中,中国发表了19篇、国外14篇。本研究主要总结的主题是病毒传播,对于描述病毒特征的论文未做盘点。

代表性主要研究成果梳理如下:

  1. Discovery of a novel coronavirus associated with the recent pneumonia outbreak in humans and its potential bat origin

作者:中科院武汉病毒所石正丽研究团队

发表时间:2020.01.22

主要内容:武汉新型冠状病毒2019-nCoV与一种蝙蝠中的冠状病毒的序列一致性高达96%,推测2019-nCoV或来源于蝙蝠。

  1. A mathematical model for simulating the transmission of Wuhan novel Coronavir

作者:厦门大学公共卫生学院陈田木团队

发表时间:2020.01.19

主要内容:研究人员建立了一个Bats-Hosts-Reservoir-People传播数学模型,以模拟从感染源(可能是蝙蝠)到人类感染的潜在传播,根据模型计算基本复制数,以评估2019-nCoV的传导性。

  1. Pattern of early human-to-human transmission of Wuhan 2019-nCoV

作者:瑞士伯尔尼大学社会与预防医学研究所Julien Riou等人

发表时间:2020.01.23

主要内容:研究人员对疫情早期暴发轨迹进行随机模拟,发现新冠病毒存在持续的人传人的潜力,且传播特征与严重急性呼吸道综合征相关的冠状病毒(SARS-CoV)和1918年大流行性流感具有类似程度,这些发现强调了加强筛查、监测和控制工作的重要性。

  1. 2019-20 Wuhan coronavirus outbreak: Intense surveillance is vital for preventing sustained transmission in new locations

作者:牛津大学数学研究所R.N. Thompson

发表时间:2020.01.24

主要内容:利用47名受感染患者从症状出现到住院治疗的时间数据,估计输入病例之后出现持续人际传播的概率,评估冠状病毒到达其他国家时持续传播的风险,强调世界各国当前监测工作的重要性。

  1. Transmission dynamics of 2019 novel coronavirus (2019-nCoV)

作者:广东省疾病预防控制中心学术团队

发表时间:2020.01.25

主要内容:收集2020年1月23日前2019-nCoV确诊病例的病历、流行病学调查或官网资料,利用指数增长(EG)和最大似然估计(ML)估计2019-nCoV和SARS的繁殖数®,结论是2019-nCoV可能比2003年爆发的SARS具有更高的大流行风险,需要更严格的控制和预防战略和措施,以遏制其进一步蔓延。

  1. The digestive system is a potential route of 2019-nCov infection: a bioinformatics analysis based on single-cell transcriptomes

作者:第二军医大学长征医院学术团队

发表时间:2020.01.30

主要内容:研究人员分析了4个含有单细胞转录组的数据集,发现消化系统和呼吸系统也是2019-nCov感染的潜在途径。

  1. Early Transmission Dynamics in Wuhan, China, of Novel Coronavirus-Infected Pneumonia

作者:中国疾病预防控制中心Li, Qun等

发表时间:2020.01.29

出版物:《The New England Journal of Medicine》

主要内容:研究人员收集2020年1月22日之前报告的NCIP实验室确诊病例的人口统计学特征、接触史和疾病时间表,描述病例特点并估计关键的流行病学时延分布。

  1. Importation and Human-to-Human Transmission of a Novel Coronavirus in Vietnam

作者:胡志明市巴斯德研究所Phan, Lan T等

发表时间:2020.01.28

出版物:《The New England Journal of Medicine》

主要内容:研究新冠病毒在越南的输入和人际传播

  1. The Extent of Transmission of Novel Coronavirus in Wuhan, China, 2020

作者:北海道大学医学院Nishiura, Hiroshi等

发表时间:2020.01.24

出版物:《Journal of Clinical Medicine》

主要内容:根据2020年1月24日前13起出口事件的报告,作者分析并预估中国新冠肺炎的累计发病率和最可信的感染数字单位。

  1. A familial cluster of pneumonia associated with the 2019 novel coronavirus indicating person-to-person transmission: a study of a family cluster

作者:香港大学医学院微生物学系Chan, Jasper Fuk-Woo等

发表时间:2020.01.24

出版物:《Lancet》

主要内容:对家庭聚集发病案例的患者的基因序列进行系统发育分析。

  1. Homologous recombination within the spike glycoprotein of the newly identified coronavirus may boost cross-species transmission from snake to human

作者:四川农业大学Chen, Rui等

发表时间:2020.01.22

出版物:《Virus Research》

主要内容:研究新冠病毒的跨物种传播,根据新鉴定的2019-nCoV冠状病毒的现有序列,结合不同动物物种之间的相对同义密码子使用(RSCU)偏差,进行全面的序列分析和比较。研究结果表明,与其他动物相比,蛇是2019-nCoV最有可能的野生动物宿主,穗糖蛋白内的同源重组可能有助于从蛇到人类的跨物种传播。

  1. Potential of large ‘first generation’ human-to-human transmission of 2019-nCoV

作者:武汉生物工程大学病毒载体工程研究中心Li, Xingguang等

发表时间:2020.01.30

出版物:《Journal of Medical Virology》

主要内容:对病毒基因组序列进行了系统发育和似然映射分析,研究结果表明: 2019-nCoV的星型信号和拓扑结构可能预示着潜在的大规模“第一代”人际病毒传播。

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